Salut,

Tout dépend de ce que tu appel "annuaire normal"?
D'un point de vue référencement, il vaut mieux privilégier les annuaires proposant un lien dur.
Un lien dur est en faite un lien normal:

<a href="http://www.monsite.com/">Mon texte</a>

ou avec un javascript permettant le comptage des cliques:

<a href="http://www.monsite.com/" onmousedown="return clk('3064')" >Mon texte</a>

Les liens sans réelle valeurs sont des liens utilisant:
Que du javascript:

<a href="JavaScript:GoToSite('http://www.monsite.com')">Mon texte</a>

Que des frames :

<frameset rows="15%,85%">
<frame src="/header.php" name="top" scrolling="no" noresize>
<frame src="http://www.monsite.com/" name="site" scrolling="yes" noresize>
</frameset>

ou utilisant l'attribut rel="nofollow" :

<a rel="nofollow" href="http://www.monsite.com/">Mon texte</a>

Ce dernier, par cette attribut, indique aux moteurs de recherches qu'il ne faut pas suivre le lien, donc ne pas l'indexer.

Il existe également d'autres méthodes néfaste comme la redirection 302 que Wikio utilisait:

Une redirection 302 indique aux moteurs une page web déplacée de façon temporaire. Une redirection 302 entraine que la page du site qui fait la redirection remplace la page d'origine aux yeux des moteurs de recherche.
Une redirection 302 ce fait généralement par le biais du fichier htaccess ou par un code php qui renvoi une entête http en 302.

En résumé, privilégie les annuaires proposant des liens en dur et rewrité...

Rewrité ??

Un lien non rewrité se présente sous la forme:

http://mon-site.com/id=2&titre=mon-titre

Un lien rewrité se présente sous la forme:

http://mon-site.com/mon-titre.html

Bien que les 2 formes soient indexés, un lien rewrité est bien mieux.